Categorie archieven: medicijnen

Eiwitstructuurvoorspeller AlphaFold kan dat nu ook met niet-eiwitten

Geplaatst op door
Beantwoorden
eiwitstructuur

De structuur van eiwitten zegt veel over zijn functionaliteit

De vorm van een eiwit zegt veel over waar dat voor dient. Tot niet zo heel lang geleden moest die vorm vaak met veel moeite worden achterhaald, tot Google in 2019 met AlphaFold op de proppen kwam. Dat schijnt het eiwitonder-zoek, in combi-natie met kunst-matige intelligentie, een heel eind op weg gebracht te hebben. Nu kan AlphaFold ook de structuur (en daarmee wisselwerking met andere verbindingen) voorspellen van andere biomoleculen dan eiwitten. Lees verder →

Evolutionair ki-systeem ‘voorspelt’ eigenschappen van stoffen

Geplaatst op door
Beantwoorden
Evolutionair algoritme voor moleculen

Het evolutionaire algoritme voor moleculen zou voor vele toepassingsgebieden te gebruiken zijn (afb: Frank Glorius et. al/Cell)

Een groep onderzoekers rond Frank Glorius van de universiteit van Münster (D) heeft een (evolutionair) algoritme ontwikkeld waarmee de structuur van verbindingen is te ‘voorspellen’, maar ook de kwantummechanische of therapeutische eigenschappen van een molecuul en zelfs of die stof giftig zou kunnen zijn voor de mens. Het gebruik van het systeem zou geen bijzondere vakkennis vereisen, stellen de onderzoekers. Ze zou in feite bruikbaar zijn in combinatie met vrijwel alle chemische (moleculaire) databestanden Lees verder →

Truc waarbij T-cellen B-cellen doden de oplossing voor reuma (?)

Geplaatst op door
Beantwoorden
Blinatumomab en ALL

Blinatumomab verbindt bij de bestrijding van ALL (acute lymfatische leukemie) kankercel en de cytotoxische T-cel (afb: National Cancer Institute)

Onderzoekstersters van, onder meer, de Friedrich-Alexander-universiteit in Erlangen-Neurenberg hebben een antilichaam, BLINA, gebruikt om T-cellen aan B-cellen te koppelen. Die gedwongen verbinding loopt slecht af voor de B-cellen. Dat zou bij (zes) reumapatiënten een eind hebben gemaakt aan de ontstekingsreacties van het eigen afweersysteem. Lees verder →

Europese rivieren (on)behoorlijk smerig

Geplaatst op door
Beantwoorden
De rivieren in Europa zijn vuil

De bemonsterde rivieren en beken en de aantallen gevonden  verbindingen (afb: Saskia Finckh et. al/Environment International)

Onderzoekers van het Helmholtzinstituut UFZ in Duitsland hebben 450 monsters genomen van 22 Europese rivieren en beken. Na analyse bleek dat die soms hoge concentraties aan stoffen bevatten die daar niet horen, tot in een monster met wel 241 chemische verbindingen van de 610 onderzochte stoffen. Dat zou vooral voor ongewervelde dieren een probleem kunnen zijn, stellen ze. De kennis over de schadelijkheid van die stoffen, vooral in combinatie, laat veel te wensen over.
Lees verder →

Cresomycine oplossing voor antiobioticaresistentie

Geplaatst op door
Beantwoorden
Multiresistente Staphylococcus aereus

MRSA (afb: WikiMedia Commons)

Onderzoekers rond Kevin Wu van de Harvard-universiteit zouden een stof hebben gesynthetiseerd, cresomycine, die veelbelovende antiobiotische eigenschappen zou hebben. Cresomycine zou ook bacteriesoorten doden die resistent zijn geworden voor veel antibiotica die nu gebruikt wordt. Allerwegen zijn onderzoekers op zoek naar nieuwe antibiotica om een dreigende resistentiecrisis af te wenden. Lees verder →

Paride-virus doodt ook gevaarlijke bacteriën in ruste

Geplaatst op door
Beantwoorden
Bacteriofaag

Bacteriofagen zijn kleine virussen die bacteriën besmetten en daarmee dodelijk voor die micro-organsimen (afb: Wiki Commons)

Bacteriofagen, virussen die het hebben voorzien op bacteriën, worden gezien als (deel)oplossing voor het problematische feit dat steeds meer bacteriën resistent zijn geworden voor steeds meer antibiotica. Probleem is alleen dat bacteriofagen alleen actieve bacteriën aanvallen en doden en rustende met rust laten. Nu schijnen Enea Maffei van de ETH in Zürich en collega’s toch een faag gevonden te hebben die ook bacteriën in ruste te grazen neemt. Lees verder →

Nieuw antibioticum in de neus gevonden

Geplaatst op door
Beantwoorden
Bacterieel antibioticum epifadine

De molecuulstructuur van het bacteriële antibioticum epifadine (afb: Andreas Peschel et. al)

Zoals al vaker hier betoogd worden steeds meer micro-organismen ongevoelig voor antibiotica. Nu hebben onderzoekers ontdekt dat de bacterie Staphylococcus epidermidis die in de neus van mensen is gevonden epifadine aanmaakt, die dodelijk is voor concurrenten van deze bacteriesoort, die zich vooral op onze huid vestigt. Die vondst lijkt een stukje van de oplossing van een steeds nijpender probleem. Minpuntje is dat de stof snel ontleed en onder gas bewaard moet worden. De stof lijkt een breed spectrum aan micro-organismen te verdelgen, maar is erg instabiel. Lees verder →

Robot- en ki-systeem vervangen laborant (?)

Geplaatst op door
Beantwoorden
Coscience: ki plus robotlab

De architectuur van het systeem met onder een (slechte) foto van een deel van het robotlab (afb: Gabe Gomes et. al/Nature)

Aan de Carnegie Mellonuniversiteit in de VS hebben onderzoekers een systeem opgezet, dat niet alleen de bereiding van scheikundige verbindingen kan plannen, maar die planning ook kan uitvoeren met behulp van labrobots. Als je Coscience, zo wordt dat systeem genoemd, vraagt om ibuprofen te synthetiseren, zoekt het ki-systeem de benodigde stoffen en reactieomstandigheden op en vertelt de robotassistent wat die moet doen. De laborant kan wel inpakken of…? Lees verder →

Rennen lijkt beter te zijn dan antidepressiva

Geplaatst op door
Beantwoorden
Josine Verhoeven

Josine Verhoeven (afb: VU/UMC)

Hardlopen lijkt voor depressieve mensen net zo effectief als antidepressiva, maar is daarnaast ook nog beter van de lichamelijke gesteldheid, constateerden onderzoeksters van het UMC in Amsterdam rond Josine Verhoeven. Ze gaven aan dat het onderzoeksresultaat beïnvloed zou kunnen zijn door de vrije keuze van de proefpersonen en verschil in ernst van de aandoening voor antidepressiva of loopsessies. Lees verder →

Club opgericht die economisch en sociaal onderzoek repliceert

Geplaatst op door
Beantwoorden

Replicatieinstituut voor economie en sociale wetenschappenIn principe is wetenschap een eerlijk ‘spel’. Wetenschappers doen onderzoek waaraan ze conclusies verbinden en sommige andere onderzoekers proberen (vooral) spraakmakende onderzoeken over te doen om te kijken of het allemaal in orde is. Repliceren of reproduceren heet dat. Dat is niet echt populair, maar het blijkt dat nogal wat onderzoek die replicatie niet doorstaat. Nu hebben onderzoekers in de economie en sociale wetenschappen oktober vorig jaar een replicatieinstituut ingericht dat replicatie (en reproductie) serieus wil gaan aanpakken en schrijven daar in het blad Nature over. Lees verder →