Tag archieven: DNA

Spellen en weblabs in de strijd tegen fraude en fouten

Geplaatst op door
Beantwoorden
EteRNA: spelen met RNA

Spelen met RNA, de gang van het ontwerpproces in EteRNA (afb: PNAS)

Volgens Adrien Treuille van de Carnegie Mellon-universiteit en Rhiju Das van de Stanford-universiteit (beide in de VS), kunnen massale  ‘weblabs’ met behulp van video-spellen fouten en fraude in de bioweten-schappen of zelfs de hele wetenschap zo veel mogelijk uitbannen. Aan die weblabs zouden dan vele niet-professionele onderzoekers kunnen deelnemen. Volgens het tweetal is die spelachtige benadering wetenschappelijk deugdelijker dat de gebruikelijke praktijk in de wetenschappen waarbij er eerst een mogelijke verklaring voor een verschijnsel wordt geopperd, waarna wetenschapper die hypothese proefondervindelijk probeert te bewijzen. Ze publiceerden hun bevindingen op de webpagina’s van het blad Trends in Biochemical Sciences (waar ik het niet kan vinden). Eerder dit jaar schreven ze een soortgelijk artikel over hun RNA-massaproject EteRNA. Lees verder →

Vrienden lijken genetisch wat meer op elkaar (dan vreemden)

Geplaatst op door
Beantwoorden
James Fowler

James Fowler, controversieel onderzoeker (?)

Twee Amerikaanse onderzoekers, Nicholas Christakis van Yale en James Fowler van de universiteit van Californië in San Diego, hebben op basis van analyse van de genetische gegevens  van de zogeheten Framingham-hartstudie geconcludeerd dat vrienden elkaar genetisch naër zijn dan vreemden. De genetische gelijkenis lijkt op een familierelatie in de vierde graad (achterachterneef of -nicht), zo laat het tweetal weten. De BBC noemt het duo ‘controversieel’. Lees verder →

Vitaminen niet alleen maar gezond

Geplaatst op door
Beantwoorden
Boek vitamine C Pauling

Boek Linus Pauling en Ewan Cameron uit 1979

Ooit predikte Nobelprijswinnaar Linus Pauling het consumeren van grote hoeveelheden vitamine C als afweermiddel tegen een myriade aan ziektes, waaronder uiteraard ook kanker. De ideeën van de in 1994 overleden Amerikaanse scheikundige  worden, als dat al niet duidelijk was, nu definitief onderuit gehaald: antioxidanten als vitamine C, beta-caroteen en vitamine E zouden kanker zelfs een handje helpen. Uit Zweeds onderzoek, gepubliceerd in Science, blijkt dat antioxidanten bij muizen longkanker versterkt. Lees verder →

Volledige DNA teenbot Neanderthaler beschreven

Geplaatst op door
Beantwoorden
Denisovagrot

De Denisova-grot in het Altaigebergte (Siberië), naamgever van de Denisovanen.

Het is toch tamelijk verbazing-wekkend nieuws dat het hele DNA van een Neander-thaler zou zijn beschre-ven uit een teenbot dat zo’n 130 000 jaar oud is en is gevonden in de Denisova-grot in Siberië. Het bot komt uit een opgraving in Siberië. Het verbazingwekkende daar aan is dat DNA organisch materiaal is en organisch materiaal vergaat snel. Naar de plaatjes die ik van de vindplaats gezien heb gaat het niet echt om een ijzige omgeving (die zou de heelheid van het erfgoed nog enigszins aannemelijk hebben kunnen maken). Voor mij is het de grote vraag hoe die linkmiechels dat voor elkaar hebben gekregen. Volgens de  The New York Times is de nauwkeurigheid van het afgelezen genoom gelijk aan die van een genoom dat gelezen is van een levend iemand. Eigenaardig.
Lees verder →

Nou is het het leven weer in klei begonnen…

Geplaatst op door
Beantwoorden
Kleileven

Schematische voorstelling van de eiwitproductie in een (klei)hydrogel (afb.: Nature-artikel)

Hebben we net een paleontoloog (fossieldeskundige) gehad die zeker weet hoe het leven op aarde een aanvang nam, nu moeten we die mededeling weer met een korrel zout nemen, (b)lijkt. Onderzoekers van de Amerikaanse Cornell-universiteit beweren dat het leven begonnen is in klei. Ze hebben hun stelling proberen te onderbouwen door in klei met behulp van DNA en aminozuren eiwitten te produceren. Hypothese nummer zoveel (met wat onderbouwing, dat wel). Lees verder →

Programmeertaal ontwikkeld om DNA te synthetiseren

Geplaatst op door
Beantwoorden
Chemische computer

Kunstenaarsimpressie van de gedachte chemische computer (foto: universiteit van Washington)

Het moet mogelijk zijn net zoals bij computers, een programmeertaal/computer te ontwikkelen waarmee stukken DNA zijn te maken die een bepaalde chemische ’taak’ uitvoeren. Op de keper beschouwd is scheikunde eigenlijk ook een vorm van programmeren: Als stof A in contact wordt gebracht met stof B onder die en die omstandigheden, dan ontstaan stoffen C en D. Zoiets. Met DNA is het allemaal wat ingewikkelder. Daarmee zou je een heel ‘netwerk’ aan chemische reacties kunnen sturen. Onderzoekers van de universiteit van Washington hebben een ‘programmeertaal’ ontwikkeld, die dienstig zou zijn voor het stroomlijnen van een hele serie chemische reacties. Lees verder →